小戸館は加治川右岸、加治川と矢櫃川との合流部で船首状の地形にある。自然の地形を巧みに利用し館跡３方向は加治川の段丘崖、矢櫃川の急崖で囲まれ自然の水堀といったところだ。現況は水田、畑地、荒地になっている。館の南東部には虎口が良好に残っている。