北側にある川が札比内川で南側が中小屋川となっている。石狩川に沿って、西側に札沼線、東側に函館本線が走っている。札比内駅は雪に埋まった感じで、駅名の表札が積雪の上に顔を出すようにあった。駅舎は晩生内駅舎と左右が逆の、同じ造りの建物である。